PPt4Web Хостинг презентаций

Главная / Биология / Программирование внутриклеточных реакций
X Код для использования на сайте:

Скопируйте этот код и вставьте его на свой сайт

X

Чтобы скачать данную презентацию, порекомендуйте, пожалуйста, её своим друзьям в любой соц. сети.

После чего скачивание начнётся автоматически!

Кнопки:

Презентация на тему: Программирование внутриклеточных реакций


Скачать эту презентацию

Презентация на тему: Программирование внутриклеточных реакций


Скачать эту презентацию



№ слайда 1 Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А.
Описание слайда:

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А.

№ слайда 2 Успехи вычислительной биологии 1944 – E. Schrodinger «What is life? The Physical
Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1944 – E. Schrodinger «What is life? The Physical Aspect of the Living Cell»1948 – самовоспроизводящиеся автоматы фон-Неймана1952 – A.M. Turing “The Chemical Basis of Morphogenesis”1953 – открытие структуры ДНК1958 – впервые найдена высокоточная пространственная структура белка1958 – сформулирована основная догма молекулярной биологии: ДНК->РНК->Белок1968 – расшифровка генетического кода

№ слайда 3 Успехи вычислительной биологии 1970 - … последовательности однотипных объектов и
Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1970 - … последовательности однотипных объектов исследуются при помощи ЭВМ:ДНК/РНК (A,C,G,T/U)белки (A,R,N,D,C,E,Q,G,H,I,L,K,M,F,P,S,T,W,Y,V)1972 – появляются открытые банки белковых структур (wwPDB - 77000 записей)1977 – секвенирование первого полного генома (фаг ФХ174, 5386 н., 11 белков)1977 – открытые банки данных геномов (NCBI)высшие организмы (859)низшие организмы (3147)вирусы (2879)

№ слайда 4 Успехи вычислительной биологии 1990 – S. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. Myers,
Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1990 – S. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. Myers, D. Lipman (October 1990). “Basic local aligment search tool” (BLAST)2001 – секвенирование полного генома человека (3,2 млрд. н., 25 тыс. белков)2004 – Luka Cardelli “Bioware Languages” 2008 – А.М. Гупал, И.В. Сергиенко «Оптимальные процедуры распознавания» 2010 – создание искусственной бактерии Mycoplasma Laboratorium (0,5 млн. н., 382 гена) 2010 – Ю.М. Романовский, А.Н. Тихонов «Молекулярные преобразователи энергии живой клетки. Протонная АТФ-синтаза — вращающийся молекулярный мотор» УФН 2011 – G. Chaitin “Life as evolving software”

№ слайда 5 Вирус иммунодефицита человека Геном вируса иммунодефицита человека представлен д
Описание слайда:

Вирус иммунодефицита человека Геном вируса иммунодефицита человека представлен двумя идентичными молекулами РНК, каждая из которых имеет длину чуть меньше 10000 нуклеотидов. Всего геном вируса включает 9 генов. Они кодируют 15 различных белков. Всего использовалось 17 белков.

№ слайда 6 Внутренняя жизнь клетки BioVisions - Inner Life of the Cell
Описание слайда:

Внутренняя жизнь клетки BioVisions - Inner Life of the Cell

№ слайда 7 Результаты Autonomy Labs как собрать коробки вместеочень простые роботыкак отсор
Описание слайда:

Результаты Autonomy Labs как собрать коробки вместеочень простые роботыкак отсортировать камни по размеруС.С. Хилькевич «Физика вокруг нас» Что происходит при встряхивании (с. 61), вибросепарация

№ слайда 8 Сравнение живой клетки и ЭВМ ЭВМ ПЗУОЗУБазовые операторыПрограммыКопирование про
Описание слайда:

Сравнение живой клетки и ЭВМ ЭВМ ПЗУОЗУБазовые операторыПрограммыКопирование программы из ПЗУ в ОЗУОсвобождение ОЗУ после выполнения программы Клетка ДНКЦитоплазмаАминокислотыБелкиСинтез белкаРаспад белка

№ слайда 9 Сравнение живой клетки и ЭВМ ЭВМ Одноядерные ЭВММногоядерные ЭВМнаследование или
Описание слайда:

Сравнение живой клетки и ЭВМ ЭВМ Одноядерные ЭВММногоядерные ЭВМнаследование или композиция в ООПдекларативный стиль в ФП Клетка прокариотыэукариотыдоменная структура белковотсутствие явно заданной последовательности белковых взаимодействий

№ слайда 10 Программирование при помощи частиц Взаимодействия между частицами задаются алгор
Описание слайда:

Программирование при помощи частиц Взаимодействия между частицами задаются алгоритмически, природа взаимодействий не изучаетсяЧастицы обладают зарядами, которые позволяют уточнять взаимодействия Составные частицы наследуют характеристики своих составляющихХарактеристики частицы зависят от ее структурыСтруктуру частицы можно описать в виде линейной последовательности символов конечного алфавитаJava->Scala

№ слайда 11 Алфавит Множество базовых частиц Множество связок вида Алфавит определяется инду
Описание слайда:

Алфавит Множество базовых частиц Множество связок вида Алфавит определяется индуктивно: ; где , ;ничто другое не является элементом .Линейное представление частицы:Представление в виде бинарного дерева:

№ слайда 12 Конфигурация Множество положений частицы в системе: , Конфигурация:Отношение сос
Описание слайда:

Конфигурация Множество положений частицы в системе: , Конфигурация:Отношение соседства: Путь длиной : ,Расстояние - длина кратчайшего пути между позициями и ; , если такого пути не существуетОкружение:

№ слайда 13 Взаимодействия Взаимодействие: Взаимодействие составных частиц:Радиус действия:
Описание слайда:

Взаимодействия Взаимодействие: Взаимодействие составных частиц:Радиус действия: , ,Пример: случайное блуждание

№ слайда 14 Напряженность Напряженность: Напряженность базовой частицыРадиус действия:Напряж
Описание слайда:

Напряженность Напряженность: Напряженность базовой частицыРадиус действия:Напряженность составных частиц:Энергия конфигурации:

№ слайда 15 Динамика системы Процедура , Выбрать с равномерной вероятностьюВычислитьВычислит
Описание слайда:

Динамика системы Процедура , Выбрать с равномерной вероятностьюВычислитьВычислить Если , то Если , то Исходная конфигурация:

№ слайда 16 Функция перехода Функция перехода :Выбор новой конфигурации :Принятие/отклонение
Описание слайда:

Функция перехода Функция перехода :Выбор новой конфигурации :Принятие/отклонение выбранной конфигурации :Функция перехода за несколько шагов:

№ слайда 17 Состояние Состояние системы , : Изменение состояния под действием :Равновесное с
Описание слайда:

Состояние Состояние системы , : Изменение состояния под действием :Равновесное состояние :

№ слайда 18 Модель Модель: - алфавит - множество позиций - отношение соседства - напряженнос
Описание слайда:

Модель Модель: - алфавит - множество позиций - отношение соседства - напряженность - взаимодействие - начальная конфигурацияДостижимые конфигурации, :Взаимно достижимые:Множество достижимых конфигураций модели :

№ слайда 19 Теорема 1 Пускай - модель системы, - множество достижимых конфигураций модели, и
Описание слайда:

Теорема 1 Пускай - модель системы, - множество достижимых конфигураций модели, и выполняются условия: , ; ; , .Тогда имеет единственное равновесное состояние ,причем:

№ слайда 20 Теорема 2 Пускай выполняются условия Теоремы 1, тогда можно указать такое число
Описание слайда:

Теорема 2 Пускай выполняются условия Теоремы 1, тогда можно указать такое число , что вероятность нахождения частицы на позиции при фиксированных частицах на позициях . в равновесном состоянии не зависит от частиц, находящихся на позициях .

№ слайда 21 Примеры Случайное блужданиеПритяжение/отталкиваниеСоставные зарядыФормирование с
Описание слайда:

Примеры Случайное блужданиеПритяжение/отталкиваниеСоставные зарядыФормирование связиВзаимодействие, зависящее от зарядаРеакция Белоусова-ЖаботинскогоРибосома и мРНК

№ слайда 22 Пример 1: составные заряды
Описание слайда:

Пример 1: составные заряды

№ слайда 23 Пример 2: мембранный транспорт
Описание слайда:

Пример 2: мембранный транспорт

№ слайда 24 Пример 3: реакция Белоусова-Жаботинского
Описание слайда:

Пример 3: реакция Белоусова-Жаботинского

№ слайда 25 www.b-squared.org.ua Спасибо за внимание
Описание слайда:

www.b-squared.org.ua Спасибо за внимание

Скачать эту презентацию


Презентации по предмету
Презентации из категории
Лучшее на fresher.ru