PPt4Web Хостинг презентаций

Главная / Биология / Что такое биоинформатика?
X Код для использования на сайте:

Скопируйте этот код и вставьте его на свой сайт

X

Чтобы скачать данную презентацию, порекомендуйте, пожалуйста, её своим друзьям в любой соц. сети.

После чего скачивание начнётся автоматически!

Кнопки:

Презентация на тему: Что такое биоинформатика?


Скачать эту презентацию

Презентация на тему: Что такое биоинформатика?


Скачать эту презентацию



№ слайда 1 Что такое биоинформатика?Банк SwissProtС.А.Спирин7, 8,10 февраля 2006 г., ФББ МГ
Описание слайда:

Что такое биоинформатика?Банк SwissProtС.А.Спирин7, 8,10 февраля 2006 г., ФББ МГУ

№ слайда 2 Что такое биоинформатика?Исследование информационных процессов в биологических с
Описание слайда:

Что такое биоинформатика?Исследование информационных процессов в биологических системах (клетках, органах, организме, популяции). Изучение и внедрение в компьютерную науку «биологических» методов анализа информации (нейросетей, генетических алгоритмов, нечеткой логики и др.). Применение компьютерных методов для решения биологических задач. Телепатия, парапсихология, информационные поля и т.п.

№ слайда 3 БиоинформатикаИсследование информационных процессов в биологических системах (кл
Описание слайда:

БиоинформатикаИсследование информационных процессов в биологических системах (клетках, органах, организме, популяции).Изучение и внедрение в компьютерную науку «биологических» методов анализа информации (нейросетей, генетических алгоритмов, нечеткой логики и др.).Применение компьютерных методов для решения биологических задач.Телепатия, парапсихология, информационные поля и т.п.

№ слайда 4 Примеры задач биоинформатикиРазработка алгоритмов для анализа большого объема би
Описание слайда:

Примеры задач биоинформатикиРазработка алгоритмов для анализа большого объема биологических данныхАлгоритм поиска генов в геномеАнализ и интерпретация биологических данных таких, как нуклеотидные и аминокислотные последовательности, структура молекул белков, структура комплексов молекул белков с другими молекулами.Изучение структуры активного центра белкаРазработка программного обеспечения для управления и быстрого доступа к биологическим данным Создание банка данных аминокислотных последовательностей

№ слайда 5 Что понимать под биоинформатикой?Как видим, смысл термина ещё ỳже...Применение к
Описание слайда:

Что понимать под биоинформатикой?Как видим, смысл термина ещё ỳже...Применение компьютерных методов для решения биологических задачПрименение компьютерных методов для решения задачмолекулярной биологии... и еще ỳже...Компьютерный анализ экспериментальных данных о структурах биологических макромолекул (белков и нуклеиновых кислот) с целью получения биологической информации

№ слайда 6 Итак...Биоинформатика = вычислительная молекулярная биологияПочему так сузился с
Описание слайда:

Итак...Биоинформатика = вычислительная молекулярная биологияПочему так сузился смысл термина?

№ слайда 7
Описание слайда:

№ слайда 8 В конце 1970-х годов был изобретён относительнобыстрый и дешёвый метод экспериме
Описание слайда:

В конце 1970-х годов был изобретён относительнобыстрый и дешёвый метод экспериментального определения последовательности оснований в ДНК

№ слайда 9 Для хранения все возрастающей информации о последовательностях ДНК в 1982 году б
Описание слайда:

Для хранения все возрастающей информации о последовательностях ДНК в 1982 году был основан GenBankGenBank — хранилище последовательностей нуклеиновых кислот в виде компьютерных файлов Объем GenBank’а:1982: 680 338 букв в 606 последовательностях1992: 101 008 486 букв в 78 608 последовательностях2002: 28 507 990 166 букв в 22 318 883 последовательностях 2004: 44 575 745 176 букв в 40 604 319 последовательностях 2005: 56 037 734 462 букв в 52 016 762 последовательностях (из ~165 000 организмов)Размер файлов — 196 Gb

№ слайда 10 Пионеры биоинформатикиЛайнус ПолингАнализ аминокислотных последовательностей гло
Описание слайда:

Пионеры биоинформатикиЛайнус ПолингАнализ аминокислотных последовательностей глобинов нескольких позвоночныхГипотеза молекулярных часовZuckerkandl, E., and L. Pauling. 1962. Molecular disease, evolution, and genic heterogeneity. Horizons in Biochemistry, Academic Press, New York, 189-225.Zuckerkandl, E., and L. Pauling. 1965. Evolutionary divergence and convergencein proteins. Evolving Genes and Proteins, Academic Press, New York, 97-166.

№ слайда 11 Пионеры биоинформатикиМаргарет ДейхоффОднобуквенный код аминокислотA,C,D,E,F,G,H
Описание слайда:

Пионеры биоинформатикиМаргарет ДейхоффОднобуквенный код аминокислотA,C,D,E,F,G,H…Матрицы аминокислотных замен PAM (Point Accepted Mutation)Атлас последовательностей белков и их структур (1965)

№ слайда 12 Первый “банк данных”Атлас белковых последовательностей и их структурПервая верси
Описание слайда:

Первый “банк данных”Атлас белковых последовательностей и их структурПервая версия атласа содержала описание 65 (!) последовательностей белков

№ слайда 13 Банки данныхАрхивные (примеры: PDB, GenBank)за содержание каждой записи отвечает
Описание слайда:

Банки данныхАрхивные (примеры: PDB, GenBank)за содержание каждой записи отвечает её автор-экспериментатор Курируемыеза содержание записей отвечают специальные люди — кураторы Автоматическиезаписи генерируются компьютерными программами

№ слайда 14 Банк данных Swiss-ProtSwiss-Prot – база знаний о белковых последовательностях Ку
Описание слайда:

Банк данных Swiss-ProtSwiss-Prot – база знаний о белковых последовательностях Курируемая база данных “Золотой стандарт” аннотации

№ слайда 15 Банк данных Swiss-ProtС 1987 поддерживается в сотрудничестве между Swiss Institu
Описание слайда:

Банк данных Swiss-ProtС 1987 поддерживается в сотрудничестве между Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)European Bioinformatics Institute (EBI)Амос Байрох Руководитель группы Swiss-Prot в Швейцарском Институте Биоинформатики

№ слайда 16 Банк данных Swiss-ProtСтатистика роста количества документовТекущий релиз 48.9 (
Описание слайда:

Банк данных Swiss-ProtСтатистика роста количества документовТекущий релиз 48.9 (24 января 2006) содержит 206586 документов

№ слайда 17 Банк данных TrEMBLTrEMBL (Translated EMBL) Формальная трансляция всех кодирующих
Описание слайда:

Банк данных TrEMBLTrEMBL (Translated EMBL) Формальная трансляция всех кодирующих нуклеотидных последовательностей из банка EMBLАвтоматическая классификация и аннотацияТекущий релиз 31.9 (24 января 2006) содержит 2 586 884 документа

№ слайда 18 Тенденция объединения
Описание слайда:

Тенденция объединения

№ слайда 19 Банк данных UniProtUniProt (Universal Protein Resource) UniProt Knowlegebase – S
Описание слайда:

Банк данных UniProtUniProt (Universal Protein Resource) UniProt Knowlegebase – SwissProt+TrEMBLUniProt Archive – UniParcUniProt Reference – UniRef

№ слайда 20
Описание слайда:

№ слайда 21 Соотношение числа белков,представленных в разных банкахПоследовательностей во мн
Описание слайда:

Соотношение числа белков,представленных в разных банкахПоследовательностей во много раз больше, чем структур!Большинство последовательностей не аннотированы!

№ слайда 22 Документ банка данных Swiss-ProtОписание документа: идентификатор, имя, дата соз
Описание слайда:

Документ банка данных Swiss-ProtОписание документа: идентификатор, имя, дата создания и модификации Аннотация последовательностиПоследовательность

№ слайда 23 Основные поля записи SwissProtIDACDEOSOCИ сама последовательность, конечно.
Описание слайда:

Основные поля записи SwissProtIDACDEOSOCИ сама последовательность, конечно.

Скачать эту презентацию


Презентации по предмету
Презентации из категории
Лучшее на fresher.ru