Кольцевая Днк, не содержащая разрывов ни в одной из цепей, может существовать в различных топологических формах. Эти формы характеризуются порядком зацепления Кольцевая Днк, не содержащая разрывов ни в одной из цепей, может существовать в различных топологических формах. Эти формы характеризуются порядком зацепления Lk-целочисленной величиной, обозначающей количество оборотов одной цепи относительно другой. Lk>0 правые витки, Lk<0 левые витки. Каждый топоизомер может существовать в бесконечном числе конформаций, которые определяются двумя параметрами – кручением Tw и райзингом Wr: Tw – число витков двойной спирали в данном конформере Wr – число витков суперспирали Связь между этими параметрами выражается в равенстве: Lk=Tw+Wr
Топоизомеразы - ферменты, способные менять топологическое состояние кольцевых ДНК. Топоизомеразы - ферменты, способные менять топологическое состояние кольцевых ДНК. Топоизомеразы I типа. Для своей работы они не требуют никаких кофакторов. Внося разрыв в одну из цепей двойной спирали, фермент ковалентно пришивается к одному из концов цепи, запасая в образованной связи энергию, необходимую для последующего воссоединения этой цепи.
Топоизомеразы типа II в ходе своей работы рвут одновременно обе нити двойной спирали ДНК и проводят сквозь разрыв другой двунитевой сегмент. В ходе такой реакции порядок зацепления ,Lk , а следовательно и число сверхвитков , должно изменяться на 2. Топоизомеразы типа II в ходе своей работы рвут одновременно обе нити двойной спирали ДНК и проводят сквозь разрыв другой двунитевой сегмент. В ходе такой реакции порядок зацепления ,Lk , а следовательно и число сверхвитков , должно изменяться на 2.
Суперспирализация прежде всего необходима для упаковки громадной молекулы ДНК в малом объеме клетки. Суперспирализация прежде всего необходима для упаковки громадной молекулы ДНК в малом объеме клетки. Суперспирализация потенциально представляет собой значительную силу, способную оказывать влияние на структуру двойной спирали. Суперспирализация ДНК, облегчающая ее расплетение, обеспечивает начало репликации и транскрипции.
Молекулярная биология: Учебник для студентов педагогических вузов / А. С. Коничев, Г. А. Севастьянова. − 2-е изд., испр. − М.: Издательский центр «Академия», 2005. 95-99 стр. Молекулярная биология: Учебник для студентов педагогических вузов / А. С. Коничев, Г. А. Севастьянова. − 2-е изд., испр. − М.: Издательский центр «Академия», 2005. 95-99 стр. http://humbio.ru/humbio/dnastructure/0002e4a9.htm http://www.siumed.edu/~bbartholomew/-lectures/Supercoiling.pdf Структура и механизм действия ДНК-топоизомераз IВ-типа © 2010 г. Д. В. Бугреев, Г. А. Невинский